Bioinformatician / NGS Data解析・Panel開発

仕事内容: 【募集背景】 米国進出に向けて、人・犬・猫の15,000 SNVsをターゲティングした新規パネルの開発が急務です。同時に、既存の解析パイプラインの最適化と、国際的な学会・論文発表を視野に入れた高度なデータ解析が必要な段階に来ています。 このプロジェクトは単なるR&Dではなく、seeDNAの次の成長を支える事業の中核です。一人目のBioinformaticianとして、パネル開発から臨床導入、そして国際展開まで、プロジェクト全体に関わる貴重な機会です。 【主な業務】 1. NGS Data解析パイプラインの運用・最適化 ■ Illumina機器から出力される10Gb以下のFastq Dataを、自社Linux Serverで処理 ■ GATK、bcftools、Samtoolsを用いた以下の解析を実行： * Copy Number Variation (CNV) 解析 * Variants Calling * 統計解析による品質評価 ■ 解析結果の出力・可視化・レポート作成 2. 新規ターゲット配列解析パネルの開発 ■ 人・犬・猫の15,000 SNVsを対象とした新規パネル設計 ■ パネル設計の最適化（カバレッジ、特異性、検出感度の検証） ■ 実際のNGSデータを用いた新規パネルの検証・改良 ■ パネルの臨床的妥当性の確認（検査チームとの共同検証） 3. 検査チームとの協働 ■ 8名の検査チームとの定期的な連携 ■ 検査結果からのフィードバックループの構築 ■ 解析ワークフローの改善提案 4. 研究成果の発表 ■ 国際学会での発表準備 ■ 論文執筆・投稿（First Author論文の発表を期待） ■ 新しいアルゴリズム・解析手法の開発と発表 【業務の特徴】 ■ 最高峰の技術者から直接学べる環境：代表（日本初の胎児DNA鑑定開発者）が直属上長 ■ 世界レベルの研究環境：各種AI Tool、高性能自社サーバーを自由に使用可能 ■ 実務と学術性の両立：自社サービスの開発と、国際的な研究発表を同時に推進 ■ グローバル展開への関与：韓国・ウクライナ・インド・アメリカへの展開プロジェクトに直接貢献

求める人材: 【必須要件】 ■ 博士号（PhD）取得（分野は問わず。バイオインフォマティクス、情報科学、生物統計学、生命科学等） ■ Python でのプログラミング経験 ■ Linux / Unix コマンドライン環境での実務経験 ■ NGS データ解析の実務経験（WGS、WES、Target Sequencing のいずれか） ■ 基本的な統計学の理解（分布、仮説検定、回帰分析など） ■ GATK、bcftools、Samtools など標準的な解析ツールの使用経験 ■ 英語での論文読解能力（国際学会や学術文献の理解） 【歓迎要件】 ■ Copy Number Variation (CNV) 解析の経験 ■ Variants Calling パイプラインの構築経験 ■ R、Perl、Bash での実装経験 ■ 機械学習・ディープラーニング技術の活用経験 ■ ゲノム参照データベース（dbSNP、ClinVar、gnomAD等）の活用経験 ■ ヘルスケア・医療領域でのNGS解析経験 ■ First Author としての論文発表経験 ■ 国際学会での発表経験 ■ 動物ゲノム（獣医学領域）での解析経験 【こんな方に向いています】 ■ 最前線のバイオインフォマティクスに挑戦したい方 ■ 基礎研究と実務を両立させたい方 ■ 国際的な研究環境で成果を発表したい方 ■ ゲノム解析の新しい手法開発に興味がある方 ■ 技術者として自らのスキルを極めたい方

月給40万円～55万円 給与: 固定残業代あり：月給 ￥400,000 〜 ￥550,000は1か月当たりの固定残業代￥23,260〜￥31,980（8時間相当分）を含む。8時間を超える残業代は追加で支給する。 * 評価基準：First Author論文数、開発実績、技術的貢献度に応じて決定 * ボーナス：固定賞与 最大2ヶ月分 * 勤務時間：9:00〜18:00（休憩1時間／固定時間制） * 休日休暇：土日祝、年末年始、慶弔休暇／年間休日122日以上 * 試用期間：2ヶ月（条件変更なし） * 各種手当：皆勤手当（月8,000円）、勤続手当、通勤手当全額支給

固定時間制 勤務時間・曜日: ■月曜日～金曜日、9:00～18:00 ■休憩1時間は各自のタイミングでとることができます。

休暇・休日: * 土、日、祝日、年末年始休業 * 慶弔休暇あり * 年間休日122日以上 * 6ヶ月経過後の年次有給休暇日数 10 日

【保険制度】 ・雇用保険 ・労災保険 ・健康保険 ・厚生年金 待遇・福利厚生: 【福利厚生】 * 各種社会保険完備 * がん保険全額支援、足立区勤労者福祉サービス加入 * 学会参加支援：国際学会参加費、論文投稿費用を会社が全額支援 * 研究環境：各種AI Tool、高性能自社サーバーを自由に使用可能 【職場環境】 * 服装、髪型、ネイルは自由です * ウォーターサーバー・電子レンジ・冷蔵庫・個人ロッカー完備 * がん保険全額支援、足立区勤労者福祉サービス加入 * 毎週１回、お菓子配布しています！

試用期間あり 試用期間：2か月 試用期間中の労働条件：同条件

その他: 【採用人数・選考フロー】 * 採用人数： 1名 * 入社時期： 即日〜応相談 * 選考フロー： 書類選考（CV・学位記・論文リスト提出） → 技術面接 → 役員面接 → 内定 【応募方法】 ご興味のある方は、以下をご提供ください： * CV（英語または日本語） * 学位記のコピー（PhD取得証明） * 発表論文のリスト（First Author、Co-author を区別） * これまでの開発・研究実績の概要 お問い合わせ： 03-6659-2997　メール： [saiyo@seedna.co.jp] 雇用形態: 正社員 給与: 400,000円 - 550,000円 月給 平均所定労働時間（1か月当たり）: 162時間

• 英語
• 残業なし
• 交通費支給